سي و هشتمين جشنواره موسيقي فجر در بخش‌هاي استان‌ها، پژوهش، غير رقابتي، جايزه باربد، جشنواره جشنواره‌ها، جايزه ترانه، جايزه موسيقي و رسانه بخش سرود و بخش بين‌الملل برگزار مي‌شود.
بخش پژوهش به مدت پنج روز به میزبانی رادیو گفتگو و زنده برگزار می‌شود و هنرمندان موسیقی و کارشناسان درباره موضوعات حوزه موسیقی به بحث و تبادل نظر خواهند پرداخت.
بخش رقابتی به منظور حضور جریان‌های نوین موسیقی و صدا در ایران که در بازنگری صورت‌های شنیداری به ایده‌پردازی و اجرا بدون پیش‌داوری مرسوم در ساخت و اجرای موسیقی متداول می‌پردازد که در این دوره به عنوان جایزه ویژه به جشنواره اضافه شده است.
جایزه باربد با هدف معرفی و تقدیر از آثار برگزیده اهالی موسیقی ایران، اعتلای هنر موسیقی و ارتقای سلیقه و فرهنگ شنیداری مخاطبان، صیانت از هویت ملی مبتنی بر آموزه‌های آیینی و ایرانی، تقویت و حمایت از هنر خلاق به ویژه ایده و اجراهای صدا وموسیقی نسل جوان برگزار می‌شود.
بخش غیر رقابتی با هدف شناسایی، ظرفیت‌سازی و حمایت از فعالیت‌های خلاقانه هنرمندان و گروه‌های موسیقی سراسر کشور با اولویت معیارهای هنری در هر شاخه از موسیقی برگزار می‌شود و شامل بخش‌های ارکسترال، کلاسیک، ردیف دستگاهی، نواحی، هنرستان‌های موسیقی و پاپ است.
جشنواره جشنواره‌ها که برای نخستین بار به عنوان بخش نمایشگاهی این دوره از جشنواره حضور دارد، پوستر و جدول ادوار مختلف جشنواره موسیقی فجر به همراه فیلم اجراهای صحنه‌ای برگزیده در دوره‌های گذشته برای مخاطبان به نمایش گذاشته می‌شود.
جایزه ترانه نیز متن ترانه‌هایی که از مهر 1400 تا مهر 1401 به صورت تک‌آهنگ یا در قالب آلبوم موسیقی از سوی مؤسسات یا اشخاص حقیقی و حقوقی پس از دریافت مجوز از دفتر موسیقی تولید و منتشر شده‌اند، توسط هیئت داوران بررسی و ترانه‌های برگزیده معرفی می‌شوند.
همچنین جایزه موسیقی و رسانه در دو محور و با هدف تجلیل از نقش اهالی رسانه در زمینه نقد و هم‌افزایی حوزه موسیقی، افزایش نقش رسانه‌ها در توجه عمومی به موسیقی و کلام، فرهنگ‌سازی با موسیقی، افزایش سواد هنر موسیقی در بین عموم جامعه، توجه به گونه های مختلف موسیقی، به ویژه موسیقی نواحی و خرده فرهنگ ها و تبیین موسیقی به عنوان کالای فرهنگی برگزار می شود.
در بخش سرود 10 گروه برای نخستین بار در یک سالن مجزا طی ایام جشنواره روی صحنه خواهند رفت و براساس برنامه‌ریزی‌ها، تقدیر از فعالان سرود و انتخاب بهترین گروه سرود بر اساس آرای مردمی از دیگر برنامه‌های این بخش است.
بخش بین‌الملل با محوریت موسیقی و با هدف تعامل و تبادل فرهنگی و هنری با حضور گروه‌های خارجی برگزار خواهد شد.
سی و هشتمین جشنواره موسیقی فجر 28 بهمن تا سوم اسفند 1401 به دبیری بهزاد عبدی در بخش‌های رقابتی و غیر رقابتی برگزار می‌شود.